Jest to jedno z najpiękniejszych dzieł gotyckich w Polsce. Kryje w sobie przepiękny Ołtarz Mariacki, jeden z największych w Europie.
Ołtarz główny z lat 1623-1640 trójosiowy, sześcio- kondygnacyjny, z bogatymi złoceniami.
Dolna część ołtarza jest pomyślana jako ogromny relikwiarz, gdyż opactwo pelplińskie słynęło z faktu posiadani bardzo licznych relikwii.
Obraz Koronacja Madonny Hermana Hana - przedstawia Maryję w chwale i triumfujący Kościół tak w niebie, jak i na ziemi. W centralnej części znajduje się wizja otwartego nieba, w którym Trójca Święta koronuje Maryję. W jabłkach - globach trzymanych przez Boga Ojca i Jezusa rozgrywają się sceny z raju - grzech pierworodny i upadek człowieka. Dla podlegającej grzechowi ludzkości znakiem nadziei jest Ukoronowana Maryja - Ona pierwsza była wolna od grzechu.
Prawdę o świętych obcowaniu podkreślają liczne rzesze świętych przedstawionych na obrazie, które wraz z ludźmi żyjącymi jeszcze na ziemi adorują Maryję.
Obraz wyraża też aktualne dążenia polityczne - zjednoczenia Europy wokół ołtarza i tronu, przedstawia postacie współczesne - cesarza Ferdynanda II i papieża Grzegorza XV, a także prymasa Polski Wawrzyńca Gembickiego oraz króla Zygmunta III w zbroi, zaś królewicz w gronostajach to syn Zygmunta III, królewicz Władysław, ale są i inni dostojnicy - hetman Stanisław Koniecpolski, inni wodzowie i rycerze, urzędnicy państwowi.
W katedrze są też 22 inne ołtarze, przedstawiające sceny z życia świętych i Pisma Świętego.
Sklepienia nawy głównej
I jeszcze bogatsze sklepienie nawy bocznej.
Pokłon Pasterzy - najsłynniejszy obraz Hermana Hana - zastosował on tu po raz pierwszy technikę światłocienia.
Obraz ten ma też głęboką myśl teologiczną - to przychodzący na ziemię Jezus jest światłem, które świeci w ciemnościach.